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El análisis profundizado de la variación genética humana permitirá a científicos identificar los factores de riesgo genéticos para las enfermedades inmunes comunes

Un grupo internacional de investigadores reveló hoy un mapa detallado de la variación genética humana dentro del complejo principal de la histocompatibilidad (MHC), de la región más importante del genoma humano que codificaba la respuesta humana a la infección, de la enfermedad autoinmune y del trasplante del órgano. El trabajo representa un jalón en el análisis de la variabilidad genética para esta región inmune fundamental y pone la fundación científica para los esfuerzos futuros dirigidos destapando las raíces genéticas de enfermedades inmune-relacionadas. Los resultados de este equipo internacional, que incluye a científicos del instituto del corazón de Montreal (MHI), el Universite de Montreal (UdeM), el amplio instituto del MIT y Harvard y varias otras instituciones de investigación, aparecen en la edición en línea anticipada del 24 de septiembre de la genética de la naturaleza.

“Este mapa nuevo será un recurso dominante para que los investigadores utilicen encontrar genes el afectar de salud, de enfermedad, y de respuestas a las medicaciones,” al Dr. mayor dicho Juan D. Rioux, PhD, que es profesor de asociado de la medicina en el UdeM y en el MHI donde él trabaja como un investigador y director del laboratorio en genética y de la medicina de Genomic de la inflamación (http://www.inflammgen.org/), que visita a científico del amplio instituto del MIT y de Harvard, y sostenedor del autor de la silla de la investigación de Canadá en genética y de la medicina de Genomic de la inflamación. “Proporcionará la información necesaria para diseñar estudios de gran alcance para identificar los factores de riesgo genéticos situados dentro del MHC.”

El artículo continúa abajo y (gracias)
 
El MHC -- específicamente, los genes que lo abarcan -- se asocia a más enfermedades que cualquier otra región del genoma humano. Esto incluye enfermedades comunes tales como atherosclerosis, artritis, diabetes, VIH, lupus, esclerosis múltiple y enfermedad de Crohn. Sin embargo, la localización de los cambios específicos que son causativos en estas enfermedades ha sido complicada por dos factores: el grado extremadamente alto de la diversidad genética que existe en el MHC entre diversos individuos y la tendencia para las diferencias genéticas múltiples en esta región de ser heredado junta en grupos llamó “haplotypes.”

Para caracterizar los patrones del haplotype del MHC, los investigadores analizaban la variabilidad en su secuencia de la DNA en más de 350 individuos de regiones geográficas diversas, incluyendo África, Europa, China y Japón. Específicamente, los investigadores “leyeron” 7.500 cambios single-letter en el código genético llamado los solos polimorfismos del nucleotide (SNPs) junto con segmentos cortos de la secuencia de la DNA de un sistema de genes altamente variables dentro del MHC, llamado los “genes de HLA.” Estos genes forman una huella digital distintiva que sea reconocida por el sistema inmune de un individuo para distinguir tejidos finos extranjeros de los tejidos finos del “uno mismo” y las secuencias de la DNA de los genes se analizan con frecuencia (un proceso llamado “HLA que mecanografía”) en los pacientes que reciben trasplantes del órgano o sufren de enfermedad autoinmune.
 
Importantemente, los datos de los investigadores y los análisis, que se hacen accesibles en línea a la comunidad científica entera, proporcionan las herramientas necesitadas para comenzar los esfuerzos iniciales hacia identificar factores de riesgo genéticos en el MHC para las enfermedades inmune-mediadas comunes. Tales esfuerzos, implicando a los investigadores en el instituto del corazón de Montreal, a la universidad de California, a San Francisco y al amplio instituto del MIT y de Harvard, ahora están en curso para varias enfermedades del sistema inmune.

Además, los resultados ofrecen penetraciones en la historia evolutiva de la región de MHC -- sus orígenes tempranos y las fuerzas evolutivas que han ayudado a formarla en un cierto plazo. Los resultados también sugieren que analizar SNPs selecto dentro de los genes de HLA pueda ofrecer un alternativa más económico para caracterizar las variantes genéticas mas comunes de la región que métodos que mecanografían estándares de HLA.

Casi tres cuartos de las muestras que habían examinado los científicos analizados previamente como parte del proyecto internacional del mapa de Haplotype (“HapMap”), una colaboración científica mundial de la DNA para catalogar la variación genética humana en una escala genoma-ancha. Los resultados más últimos, particularmente los análisis de la región del gene de HLA, proporcionan la nueva y complementaria información que se puede integrar con datos del proyecto recientemente terminado de HapMap así como otros esfuerzos genomic, para proporcionar una vista comprensiva de la variabilidad genética en el MHC humano.
Acceso de los datos

Los datos del proyecto serán hechos público disponibles en los Web site siguientes:

http://www.inflammgen.org/

de Bakker P.I.W. y otros. (2006) Mapa de un haplotype de alta resolución de HLA y de SNP para los estudios de la asociación de la enfermedad en el ser humano extendido MHC. Doi de la genética de la naturaleza: 10.1038/ng1885

Una lista completa de sus afiliaciones del estudio de los autores y:

Paul I.W. de Bakker (1.2.16), Gil McVean (3.16), Pardis C. Sabeti (1.16), Marcos M. Miretti (4.16), verde de Todd (1), Jonatán Marchini (3), Xiayi Ke (5), Alienke J. Monsuur (6), Pamela Whittaker (4), Marcos Delgado (4), Jonatán Morrison (4), Angela Richardson (1), Emily C. Walsh (1), Xiaojiang Gao (7), Luana Galver (8), ciervo de Juan (9), David A. Hafler (10), Margaret Pericak-Vance (9), Juan A. Todd (11), marca J. Daly (1.2), Juan Trowsdale (12), Cisca Wijmenga (6), Tim J. Vyse (13), cuba de tintura de Stephan (4), Sarah Shaw Murray (8), Maria Carrington (7), Simon Gregory (9), Panos Deloukas (4), Juan D. Rioux (1.14.15)

1. Programa en genética médica y de la población, amplio instituto de Harvard y MIT, Cambridge, Massachusetts, los E.E.U.U.
2. Centro para la investigación genética humana, hospital general de Massachusetts, Boston, Massachusetts, los E.E.U.U.
3. Departamento de la estadística, universidad de Oxford, Oxford, Reino Unido
4. Instituto de Sanger de la confianza de Wellcome, Hinxton, Reino Unido
5. Centro para la genética humana, universidad de la confianza de Wellcome de Oxford, Reino Unido
6. Sección compleja de la genética, departamento de la genética médica, centro médico Utrecht, los Países Bajos de la universidad
7. Laboratorio de Genomic Diversity, SAIC-Frederick, Inc., NCI-Frederick, Frederick, Maryland, los E.E.U.U.
8. Illumina, Inc., San Diego, California, los E.E.U.U.
9. Centro para la genética humana, centro médico de Duke University, Durham, Carolina del Norte, los E.E.U.U.
10. Brigham y hospital de las mujeres, departamento de la neurología, Boston, Massachusetts, los E.E.U.U.
11. Fundación de la investigación de la diabetes/diabetes de la confianza de Wellcome y laboratorio juveniles de la inflamación, instituto para la investigación médica, universidad de Cambridge de Cambridge
12. Instituto para la investigación médica, hospital de Addensbrookes, camino de las colinas, Cambridge, Reino Unido de Cambridge
13. Universidad imperial de Londres, Londres, Reino Unido
14. Universite de Montreal, departamento de la medicina, Montreal, Quebec, Canadá
15. Instituto del corazón de Montreal, Montreal, Quebec, Canadá 16. Estos autores contribuidos igualmente

Sobre el instituto del corazón de Montreal
Fundado en 1954, el instituto del corazón de Montreal apunta constantemente para las mayores niveles de la excelencia en el campo cardiovascular con su dirección en la prevención, cuidado ultra-especializado, entrenamiento de profesionales, investigación clínica y fundamental, y gravamen de nuevas tecnologías. Es afiliada con el Universite de Montreal y sus resultados clínicos están entre el mejor del mundo. El centro de investigación de MHI entró en oficialmente existencia en 1976 y ha hecho pasos grandes enormes desde su creación. Hoy, hay aproximadamente 450 empleados, estudiantes e investigadores en el centro de investigación de MHI. La característica excepcional Del MHI es el equilibrio que alcanza entre la investigación básica, investigación clínica y cuidado clínico. Sus campos primeros del foco de investigación son enfermedades vasculares, función del miocardio y electrofisiología. Genomics (pharmacogenomics incluyendo), los biomarkers y la cardiología preventiva son otras áreas del foco. Para aprender más sobre el instituto, visitar por favor nuestro Web site en http://www.icm-mhi.org/.

Sobre el Universite de Montreal
Fundado en 1878, el Universite de Montreal tiene hoy 13 facultades y junto con sus dos escuelas afiliadas, HEC Montreal y Ecole Polytechnique, constituye el centro más grande de una educación más alta y de la investigación en Quebec, el segundo más grande de Canadá, y uno de los centros principales en Norteamérica. Reúne a 2.400 profesores y los investigadores, acomodan a casi 55.000 estudiantes, ofrecen unos 650 programas en todos los niveles académicos, y las concesiones cerca de 3.000 amos y diplomas del doctorado cada año.

Sobre el amplio instituto del MIT y de Harvard

Fundaron al amplio instituto del MIT y de Harvard en 2003 para traer la energía del genomics a la biomedecina. Persigue esta misión autorizando a científicos creativos para construir las herramientas nuevas y robustas para la medicina genomic, para hacerlas accesibles a la comunidad científica global, y para aplicarlas a la comprensión y al tratamiento de la enfermedad.

El instituto es una colaboración de la investigación que implica a la facultad, a las personas cualificadas y a estudiantes a través de las comunidades académicas y médicas del MIT y de Harvard. Es gobernada en común por las dos universidades.

Organizado alrededor de programas científicos y de plataformas científicas, la estructura única del amplio instituto permite a científicos colaborar en proyectos transformative a través de muchas disciplinas científicas y médicas.

Para la información adicional sobre el amplio instituto, ir a http://www.broad.mit.edu/.

Información del contacto: Príncipe de Doris
Cabeza, comunicaciones y relaciones públicas
Instituto del corazón de Montreal

Contacto: Orujo Tulin
Universidad de Montreal

   
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