Ottenendo ai meccanismi di fondo della replica è operazione facile. Gli studi strutturali coinvolgono cristallizzare i complessi della DNA-proteina per vedere come interagiscono. I biochimici esaminano gli agenti di una reazione, l'energia usata e lasso di tempo quanto fra i punti. Tale studia la misura il comportamento delle centinaia di migliaia di molecole alla volta ed i risultati descrivono un'intera popolazione delle reazioni.
Usando l'analisi di fluorescenza della singolo-molecola, il gruppo di ricerca ha seguito come il helicase di epatite C, NS3, ha svolto una molecola collegata del DNA etichettata con un'etichetta fluorescente su ogni filo della relativa regione double-stranded. (Il helicase NS3 soprattutto è coinvolto nello svolgimento del RNA single-stranded del virus di epatite, ma può anche comportarsi su DNA. Ciò suggerisce che il helicase svolga un ruolo nello svolgimento del DNA double-stranded ospite durante l'infezione. Il duplex generato per l'esperimento ha incluso sia il DNA single- che double-stranded; le etichette fluorescenti sono state situate nella regione double-stranded.)
Seguendo la distanza gradualmente aumentante fra i due nucleotidi contrassegnati come i fili separati in un evento di svolgimento, i ricercatori potevano misurare il tasso a cui lo svolgimento si è presentato. Che cosa hanno trovato era che il DNA si è svolto nei salti discreti: Tre accoppiamenti del nucleotide (accoppiamenti bassi) hanno dovuto unhitched l'uno dall'altro prima che un evento di svolgimento accadesse.
“È come voi sta aggiungendo il tensionamento ad una molla,„ ha detto il U. del professor Taekjip ha, un ricercatore sullo studio e una filiale di fisica del I. dell'istituto per biologia di Genomic e dell'istituto medico del Howard Hughes. “State caricando la molla con i piccoli movimenti meccanici fino a che infine non abbiate accumulato abbastanza tensionamento sul complesso della DNA-proteina per causare lo svolgimento veloce di tre accoppiamenti bassi.„
Tali reazioni sono energico intense, richiedendo l'input del trifosfato di adenosina (ATP) una fonte cellulare del combustibile. I ricercatori hanno osservato che tre molecole del trifosfato di adenosina sono state consumate in ogni reazione di svolgimento, indicante che tre “punti nascosti,„ ciascuno che coinvolge unhitching di un accoppiamento basso, accaduto per ogni evento di svolgimento.
Anche se una molecola del trifosfato di adenosina contiene abbastanza energia per svolgere l'altretanto come 10 accoppiamenti bassi, i ricercatori hanno detto che non sono stati sorpresi dai costi ad alta energia della reazione. |
