Nuove promesse di ricerca di proteomics rivoluzionare scoperta biomedica

“In questo lavoro, abbiamo approfittato di una proprietà intrinseca delle proteine per mettere a punto un metodo che usiamo per arguire una funzione presunta a molte proteine precedentemente atipiche„, abbiamo detto che Dott. Coulombe che è molto emozionante dal successo della sua squadra ed i prospetti futuri questi sforzi tengono. La proprietà unica delle proteine, sfruttata da questo gruppo di ricerca di Montreal, è il fatto che le proteine funzionano raramente da solo, ma piuttosto monta con altre proteine nei complessi concertedly per impiegare la loro funzione. La strategia dei ricercatori di IRCM era basicamente di identificare i soci di interazione di molte proteine della funzione ben nota, usando le procedure specializzate di proteomics e le procedure che di calcolo si sono sviluppate. La congettura iniziale degli scienziati era che le proteine che interagiscono insieme sono probabili essere soci nella stessa via biologica e, conseguentemente, servire le stesse (o riferito) funzioni. Sistematicamente identificando i soci di interazione di 32 proteine umane conosciute per impiegare le funzioni specifiche in trascrizione e RNA del gene che procedano, la squadra di Coulombe ha definito una rete complicata di 805 interazioni di alto-fiducia che collegano insieme 436 proteine differenti. Fra loro, molte proteine della funzione precedentemente sconosciuta possono ora essere funzioni presunte arguite basate sulla loro associazione. Per confermare che le proteine fisicamente d'interazione inoltre sono riferite dal punto di vista funzionale, i ricercatori hanno selezionato un certo numero di proteine precedentemente atipiche presenti nella loro rete ed analisi funzionali più dettagliate condotte. “La specificità della nostra procedura per identificare i soci dal punto di vista funzionale relativi di interazione è stupefacente„, ha detto il Dott. Coulombe. “Per esempio, presentiamo nell'articolo molecolare delle cellule la scoperta attesa da tempo di un enzima cellulare che regola la stabilità di piccole molecole del RNA che svolgono i ruoli fondamentali nella funzione e nella regolazione delle cellule. L'esistenza e l'importanza di questo enzima sono state riconosciute per più di una decade, ma era stato finora impossible da isolarla nel mare delle proteine che compongono le cellule umane e più ulteriormente le caratterizzano. Siamo riuscito a trovare l'enzima, che abbiamo chiamato MePCE, come un socio di interazione di un'altra proteina che cellulare regola„. Molte altre proteine importanti sono state scoperte in questa analisi ed i loro ruoli precisi nella funzione delle cellule saranno pubblicati durante i mesi e gli anni venenti.

Definendo i programmi delle interazioni della proteina che regolano lo sviluppo delle cellule, la differenziazione e la progressione di malattia è l'obiettivo generale dell'iniziativa umana di Proteotheque (HuPI), un progetto lungimirante condotto nel laboratorio di Coulombe. La centrale al progetto HuPI è la relativa piattaforma sperimentale, chiamata “il motore di scoperta di HuPI„, che infine genera i programmi delle reti di interazione della proteina. L'articolo molecolare delle cellule segnala sulla prima generazione di questa piattaforma di tecnologia che attualmente sta miglioranda da una squadra pluridisciplinare di scienziati.

“Che cosa è la più importante è di sviluppare la a altamente - conduttura certa ed efficiente di scoperta che genera i programmi di interazione che sono sia completi che esatti come possibile„. Il Dott. Coulombe gradice confrontare il suo motore di scoperta di HuPI al Search Engine di Google per il Internet. La fissazione sul posto del metodo che genera le informazioni inutili sarebbe una perdita di tempo e risorse. Invece, Coulombe mira a schierare tutti gli energia e potere di cervello costruire una conduttura di scoperta di proteomics che redige le soltanto informazioni relative e utili (poichè Google è inoltre efficiente tracciare i collegamenti utili per una ricerca di fotoricettore, omettenti la maggior parte delle informazioni irrilevanti). Dato il successo veduto finora, il Dott. Coulombe può bene essere sulla strada di destra per realizzare il suo obiettivo a lungo termine che è di sviluppare un repertorio publicly-available dei programmi molecolari che rappresenta l'impronta digitale della condizione fisiologica delle cellule umane normali e la firma di alcuni stati di malattia. “Se questo repertorio completo delle reti di interazione della proteina, chiamato il Proteotheque umano, può aiutare gli scienziati universalmente nell'identificazione delle proteine nuove importanti che possono essere usate per diagnosticare e/o finalmente curare le malattie specifiche, quindi sarò riuscito a fare che cosa preciso per fare„, il Dott. conclusivo.

Riferimento: Célia Jeronimo, Diane dimentica, Annie Bouchard, Qintong Li, Gordon Chua, Poitras cristiano, Cynthia Thérien, Dominique Bergeron, Sylvie Bourassa, Jack Greenblatt, Benoit Chabot, tipo G. Poirier, Timothy R. Hughes, Mathieu Blanchette, prezzo di David H. e Benoit Coulombe. (2007) L'analisi sistematica della rete di interazione della proteina per il macchinario umano della trascrizione rivela l'identità dell'enzima di coperchiamento 7SK. Cellula Th molecolare degli il 27, e il luglio 20, edizione 2007.

Benoit Coulombe è direttore della trascrizione del gene e del laboratorio di Proteomics e la piattaforma di scoperta di Proteomics dei IRCM (cliniche de Montréal di Institut de recherches). È inoltre professore nel reparto della biochimica del Université de Montréal. Questa ricerca è costituita un fondo per da Genome Québec, il genoma Canada, gli istituti canadesi della ricerca di salute (CIHR) e le scienze naturali ed il Consiglio di Ricerca di ingegneria del Canada (NSERC).

Stabilito in 1967, i IRCM (www.ircm.qc.ca) è riconosciuto come uno dei centri di ricerca d'effettuazione di salute del paese. Ha un mandato per capire le cause ed i meccanismi delle malattie per trovare gli attrezzi diagnostici ed i mezzi di prevenzione e di trattamento; per per addestrare una nuova generazione di scienziati ad alto livello; e per contribuire a sviluppo socio-economico del Québec facilitando sviluppo commerciale di nuove scoperte. I IRCM ha 37 unità di ricerca e un personale più di di 450.