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Neue Methode, zum der Drogeziele aufzudeckenInteraktionen zwischen Proteinen studierten auf einer globalen SkalaWellcome Vertrauen Sanger Institutwissenschaftler haben eine neue großräumige Methode entwickelt, um die Interaktionen zwischen Proteinen zu identifizierenen, die ein Hauptziel für therapeutische Intervention sind. Die neue Methode kann die schwachen, kurzlebigen Interaktionen identifizierenen, die von den Zellenantworten zu den Stichwörtern von der Umwelt oder innerhalb vom Körper charakteristisch sind. Zellenoberflächenproteine sind Ziele für viele Drogen und sind zu vielen Prozessen der Zellenregelung, wie etwas Krebstherapeutik, Diabetes und Wachstum zentral. Die Mannschafthoffnung die Methode deckt viele wichtigen Interaktionen auf, die zu den gegenwärtigen Abfragungsmethoden unsichtbar sind. Viele Proteine treten als die molekularen Schalter auf und reagieren Prozesse auf der Signale und des Aktivierens spezifische Gene oder spezifische Zellen. Unter Verwendung der biochemischen Tricks, zum der Wahrscheinlichkeiten der Entdeckung das vorübergehende und das schwach, aber möglicherweise wichtig, Interaktionen zu erhöhen, beschreiben die Wissenschaftler 17 neue Paare Interaktionen in den Säugetier- Zellen. „Wenn ein Genom der Code für das Leben ist, sind Interaktionen zwischen Proteinen das Kommunikationssystem - das Internet unserer Körper,“ erklärt Dr. Gavin Wright, Juniorforscher am Wellcome Vertrauen Sanger Institut. „Die Herausforderung, die wir gegenüberstellen, ist, dass gegenwärtige Methoden Interaktionen nicht am Platz leistungsfähig ermitteln können, in dem Kommunikation beginnt: die Zellenoberfläche noch kann sie vorübergehende schwache Interaktionen zuverlässig ermitteln. „Unsere neue Methode wandelt die großräumige Suche nach diesen wichtigen Interaktionen.“ um Anders als DNA ist das Der Reihe nach ordnen, wo Methoden für alle Organismen allgemein sind, dort keine Annäherung gewesen, die einen globalen Sitz für alle verschiedenen Proteinprotein Interaktionen gibt. Die neue Methode, genannt AVEXIS, sollte auf Interaktionen an der Zellenoberfläche in vielen Organismen anwendbar sein. Drogeziele sind häufig Proteine an der Oberfläche der Zelle, da sie leicht zu den Drogen im Gegensatz zu Proteinen innerhalb unserer Zellen zugänglich sind. Leider ist der gegenwärtige Katalog der bekannten Proteininteraktionen weg von diesen Proteinen einfach voreingenommen, weil es keine leistungsfähige Methode gab, zum sie zu überprüfen. Effektiv ist eine Bahn der klinisch wichtigen Ziele unsichtbar zu erforschen. „AVEXIS erlaubt uns jetzt, die Jagd für biologisch einzustufen und klinisch setzt wichtige Proteinprotein Interaktionen,“ Dr. Wright fort. „Diese Interaktionen sind wie Velcro® - jeder Haken kann nur schwach binden, aber zusammen, können sie einen sehr starken Effekt haben. Wir erhöhten die Stärke, indem wir zusammen erfassten die Proteine, wie eines kleinen Schrottes von Velcro®.“ Die Mannschaft identifizierenten bisher nicht dargestellten Interaktionen in einer Kategorie Proteine benannten den Immunoglobulin Superfamily: diese Gruppe Proteine teilt Eigenschaften, die wichtig sind, Zellen auf ihre Umwelt reagieren, mit gegenseitig sprechen und zusammen haften zu lassen. Unter Verwendung der menschlichen Proteine und des zebrafish als Modell, betrachteten die Sanger Institutforscher Interaktionen zwischen 110 Proteinen in diesem Superfamily - insgesamt mehr als 6000 Experimente. Sie fanden 17 Interaktionen, die zwingenden Standards der Zuverlässigkeit entsprachen, von denen mehrere für weniger als 0.1 Sekunden in den Zellen dauern würden. Für jedes schauten sie, um zu sehen, wo die Proteine in den zebrafish Embryos waren. Sie fanden breit zwei Kategorien; die, in denen beide Proteinpartner anwesend im gleichen Gewebe (und wahrscheinlich sind, in Zellenadhäsion mit einbezogen zu werden) und die, in denen sie in anliegenden Geweben anwesend sind (und in Kommunikation zwischen Geweben folglich wahrscheinlich mit einbezogen werden). Hälfte der Proteine wirken auf mehr als ein anderes Protein ein und bilden Interaktionsnetze. Die Resultate liefern das erste Netz der Niedrigaffinität Interaktionen zwischen Proteinen auf der Zellenoberfläche und dem ersten Satz der umfangreichen Daten im zebrafish, ein führender Organismus für den Effekten der Genunterbrechung sichtlich folgen. „AVEXIS wird nicht auf nur einen spezifischen Organismus eingeschränkt und könnte in vielen Zusammenhängen verwendet werden,“ erklärt Dr. Wright. „Wir fanden in den zebrafish neuen Interaktionen für gut studierte Proteine und können erwarten, dass wir in der Lage sind, unser Verständnis der menschlichen Proteininteraktionen ähnlich anzureichern. „Die neuen Interaktionen können direkt zur Studie der Proteinverteilungsmuster und zu Anwärter für das Drogezielen führen. Wenn eine Interaktion einen Bestandteil ermangelt, der einer Krankheit zugrunde liegt, dann kann man suchen, kleine Moleküle oder Antikörper zu finden, die fungieren, um das Netz am Punkt anzuregen, in dem das abwesende oder dysfunktionelle Protein würde sein aktiv.“ Die Sanger Institutmannschaft sind interessiert, an, diese Methode anzuwenden, um die Proteine auf unseren Zellen zu identifizierenen, zu denen Krankheitserreger anbringen: der Kontakt zwischen Krankheitserregerproteinen und ihren Wirtszelleoberflächenempfängern ist häufig das einleitenereignis während der Infektion. Weil extrazellulare Proteine zu den Drogen bereitwillig zugänglich sind, die durch den Blutstrom geliefert werden, sollte AVEXIS helfen, neue therapeutische Gelegenheiten in genetischem und in den Infektionskrankheiten zu identifizierenen.
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Anmerkungen zu den Herausgebern Publikationsdetails Bushell Kilometer et al. (2008) Siebung der großen Skala für extrazellulare Proteininteraktionen der neuen niedrigen Affinität. Genom-Forschung, veröffentlicht on-line-22. Februar 2008 Web site Zellen-signalisierendes Oberflächenlabor: http://www.sanger.ac.uk/Teams/Team30/ Das Wellcome Vertrauen Sanger Institut, das die Majorität seiner Finanzierung vom Wellcome Vertrauen empfängt, wurde in 1992 als der Fokus für Großbritannien gegründet, das Bemühungen der Reihe nach ordnet. Das Institut ist für die Beendigung der Reihenfolge von ungefähr Drittel des menschlichen Genoms sowie Genome der vorbildlichen Organismen wie Maus und zebrafish und mehr als 90 Krankheitserregergenome verantwortlich. Im Oktober 2005 wurde neue Finanzierung durch das Wellcome Vertrauen zugesprochen, um dem Institut zu ermöglichen, auf seinen Weltklasse- wissenschaftlichen Ausführungen zu errichten und den Reichtum der Genomdaten jetzt auszunutzen, die, um wichtige Fragen über Gesundheit und Krankheit zu beantworten vorhanden sind. Diese Programme werden um eine Lehrkörper von mehr als 30 Leitern einer Forschungsgruppe aufgebaut. Das Wellcome Vertrauen Sanger Institut basiert in Hinxton, Cambridge, Großbritannien. Das Wellcome Vertrauen ist die größte Nächstenliebe in Großbritannien. Es finanziert erfinderische biomedizinische Forschung, in Großbritannien und international und jedes Jahr wendet um £650 Million auf, um die hellsten Wissenschaftler mit den besten Ideen zu stützen. Das Wellcome Vertrauen stützt öffentliche Debatte über biomedizinische Forschung und seine Auswirkung auf Gesundheit und Wohl.
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