Das m2-Protein ist im Virenumschlag und bildet einen langen, schmalen Kanal, der den Fluss der Protone in den Vireninnenraum erlaubt, einen wesentlichen Schritt für Infektion. Amantadin sitzt in diesem Kanal und blockiert den Fluss der Protone und so stellt Infektion ein. In den Non-resistantviren fungiert Amantadin wie ein Korken, der tief im Kanal untergebracht wird.
„Wir wissen, dass Widerstand zum Amantadin durch eine Veränderung im Virus M2-Protein verursacht wird, aber wir konnten nicht, diese Veränderung Widerstand verursachte,“ erklären älteren Autor William F. DeGrado, PhD, Professor von Biochemie und von Biophysik. „Jetzt tun wir - die Veränderungänderungen die Form des Kanals also des Amantadins können seine Arbeit nicht mehr erledigen.“
Die Struktur deckte auf, dass es eine Tasche im Kanal nahe bei der Position in der Amantadinsitze gibt, die in allen Viren der Grippe A konserviert wird. Dieser eben entdeckte Raum konnte das Ziel für neue Drogen sein. „Hemmnisse, die diesen Raum neben zwei in hohem Grade konservierten Aminosäuren in M2 zielen, konnten die M2-blocking Kategorie der Drogen zurückfordern, damit laufende endemische Ausbrüche und zukünftige Pandemien dieses tödlichen Virus verhindert werden und behandelt werden konnten,“ sagt DeGrado.
„Die Kristallstrukturen der Grippe M2 mit und ohne der Anti-grippe Droge helfen uns, die molekulare Basis des Drogewiderstands zu verstehen, der ein ernstes Problem ist, wenn die Grippe behandelt wird,“ sagten Jean-Kinn, PhD, der Bewilligungen auf Membranenproteinen am nationalen Institut der allgemeinen medizinischen Wissenschaften beaufsichtigt, die im Teil diese Forschung finanzierten. „Die Entdeckungen informieren die Wissenschaftler, die arbeiten, um das folgende Erzeugung von Antivirals zu entwerfen.“
Das m2-Protein wurde kristallisiert, damit seine Struktur unter verschiedenen Bedingungen überprüft werden konnte. Dieses erlaubte das Penn Forschungsteam, das enthaltene Amanda Stouffer, Rudresh Acharya, David Salom, Cinque Soto, Luigi Di Costanzo, Steven Stayrook, Vikas Nanda und Anna Levine, die Struktur des kristallisierten Proteins unter Verwendung einer Technik festzustellen Röntgenstrahlkristallographie anriefen.
Der reine Proteinkristall wurde mit Röntgenstrahlen bombardiert, damit die Position jedes Atoms in Beziehung zu seinen benachbarten Atomen im Kristall sich als Reihe schwarze Punkte zeigen würde. Vom Muster von Tausenden Punkten, kann die Struktur des Proteins unter Verwendung der Computer-Bildgebungstechnologie grafisch sichtbar gemacht werden.
Der folgende Schritt ist, neue Mittel zu entwerfen, die den M2-Kanal verstopfen, indem sie in den eben entdeckten größeren Raum passen. Die Penn Forschungsgruppe nimmt z.Z. an diesen Studien teil.
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Diese Studie wurde vom nationalen Institut der allgemeinen medizinischen Studien, des Kimberly-und Margaret-DeLape Stipendiums, des Programms der Universität von Pennsylvanien MRSEC und der National Science Foundation gestützt.
Valentina Tereshko der Universität von Chicago trug auch zu dieser Studie bei.
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