Forscher decken Arten der Gene auf, die für Gehirnentwicklung notwendig sind

Forscher von der Harvard-Medizinischen Fakultät und von der Brandeis Universität haben erfolgreich einen Vollgenom RNAi Schirm in den Neuronen abgeschlossen und gezeigt, welche Arten der Gene für Gehirnentwicklung notwendig sind. Details des Schirmes und seiner neuen Methodenlehre werden 4. Juli in der Öffnenzugang Journal PLoS Genetik veröffentlicht.

Neue Fortschritte im Genomics, wie dem Der Reihe nach ordnen der gesamten Genome und der Entdeckung der RNS-Störung als Mittel der Prüfung der Effekte des Genverlustes, haben die Möglichkeit erschlossen, um die Funktion aller bekannten und vorausgesagten Gene in einem Organismus systematisch zu analysieren. Bis jetzt ist diese Art der Funktionsgenomicsannäherung nicht an der Studie der sehr komplizierten Zellen, wie der Neuronen des Gehirns, auf einer Vollgenom Skala angewendet worden.

Dr. Katharine Sepp und ihre Mitforscher nahm die neuen neuronalen Zellen, die von den Embryos der Fruchtfliegenklasse Taufliege extrahiert wurden und sortierte sie unter Verwendung der RNS-Störungstechniken aus. Die Mannschaft prüfte alle Gene, eins nach dem anderen in einer schnellen Weise, auf ihre mögliche Rolle in der neuronalen Entwicklung. Die Mannschaft validierte dann die Methode in den Mäusen.

Eine Kombination der Lebenzelle Darstellung und der quantitativen Analyse erlaubte Sepp et al., morphologische Phänotypen der Neuronen in Erwiderung auf RNAi-vermittelten Gen Knockdown zu kennzeichnen. Die Forscher konzentrierten sich auf 104 konservierte Evolutionsgene, die, wenn sie durch RNAi downregulated, morphologische Defekte haben. Die Mannschaft entwickelten Algorithmen, zum von Stromlinie zu helfen, welche die Analyse der Tausenden von Bildern im Prozess verursachte.

Die Analyse deckte die unerwarteten, wesentlichen Rollen im neurite Ergebnis für die Gene auf, die eine große Auswahl von Funktionskategorien einschließlich Signalisierenmoleküle darstellen, die Enzyme, die Kanäle, die Empfänger und die zytoskelettproteine. Resultate stellten auch dass die Gene fest, die bekannt sind, in RNAi Erscheinen des Proteins und des Vesicle mit einbezogen zu werden handelnde ähnliche Phänotypen.

Die Forscher glauben, dass diese Studie eine wirkungsvolle Methode für zukünftige Studien einer großen Vielzahl der Gene zur Verfügung stellt, einschließlich die mit wichtigen Funktionen im Nervensystem.

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ZITIEREN: Sepp kJ, Hong P, Lizarraga SB, Liu JS, Mejia LA, et al. (2008) Kennzeichnung der neuralen Ergebnis-Gene unter Verwendung Genom-Breiten RNAi. PLoS Genet 4 (7): e1000111. doi: 10.1371/journal.pgen.1000111

KONTAKT:

Dr. Katharine Sepp
ksepp@genetics.med.harvard.edu

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